Zakres czynności Komisji Do zakres czynności Komisji Nadzwyczajnej należało: wykrywanie i dochodzenie wszelkich czynów karygodnych, zwalczanie czynów naruszających interesów Państwa w urzędach, instytucjach i przedsiębiorstwach państwowych, zwalczanie czynów występujących w monopolach, zakładach, fundacjach, stowarzyszeniach i spółkach, działających z udziałem finansowym Skarbu Państwa, prowadzenia śledztw w jednostkach korzystających z gwarancji lub pomocy finansowej Państwa.
Zakres czynności Komisji nie obejmował zakładów, fundacji i stowarzyszeń, służących wyłącznie celom religijnym lub naukowym.
Skład Komisji Komisja składała się z przewodniczącego i czterech członków mianowanych przez Prezydenta RP na wniosek Rady Ministrów spośród sędziów i prokuratorów cywilnych i wojskowych. Ponadto w skład Komisji wchodzili członkowie Kolegium Najwyższej Izby Kontroli.
Wniosek o mianowanie sędziego lub prokuratora przedstawiał Radzie Ministrów właściwy minister. Wniosek o mianowanie członka Kolegium Najwyższej Izby Kontroli był przedstawiony w porozumieniu z prezesem NIK.