Jako osobne przedsiębiorstwo (spółka akcyjna) została zarejestrowana 26 listopada 2001.www.krs-online.pl W kwietniu 2001 roku PKO Banku Polski odkupił udziały od Banku Śląskiego S.A. stając się jedynym właścicielem eService. Jako pierwsze centrum rozliczeniowe w kraju, wprowadziła w 2007 roku czytniki kart bezstykowych.
Ekspansja i ewolucja spółki (2011-2015) W lipcu 2013 udział eService w ogólnej wartości płatności kartowych dokonywanych w Polsce wyniósł ponad 30 proc. 7 listopada 2013 roku PKO Bank Polski S.A. zawarło umowę z EVO Payments International Acquisition GmbH dotyczącej nabycia przez nią udziałów w eService. W jej wyniku 31 grudnia 2013 roku eService S.A. przekształcono w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością.
Rozwój międzynarodowy (od 2016) W 2016 roku eService skoncentrowało się na rozwijaniu ekspansji międzynarodowej prowadząc działalność, m.in. w Czechach, Słowacji, Węgrzech, Gibraltarze czy Rumunii. Firma wprowadziła także szereg nowych produktów i usług, takich jak płatności mobilne i portfele elektroniczne.