Deflandre, na podstawie dobrze zachowanych materiałów z Montagne Noire, opisał najpierw nowy rodzaj Albailella (nazwany na cześć przyrodnika-amatora o nazwisku Albaille, który przysłał mu pierwsze znaleziska), a potem nowy rząd Albaillellaria.
Inne Deflandre badał też mikrofaunę krzemieni mezozoicznych i kenozoicznych.
Wybrane publikacje Deflandre opublikował około trzystu prac naukowych, pomiędzy którymi znajdują się oryginalne prace naukowe, rozdziały w monografiach i pozycje popularonaukowe, na przykład:
Classe des Ébriédiens; Classe des Silicoflagellidés; Classe des Coccolithophoridés (rozdziały w Traité de Zoologie, 1 (1), 1952) La vie créatrice de roches (1967, w serii Que sais-je);
Opisane taksony Niektóre taksony wyższej rangi opisane przez Deflandre'a:
Podklasa Ebriidea Deflandre, 1936 (, wiciowce o szkielecie krzemionkowym); Rząd Albaillellaria Deflandre, 1953 (promienice paleozoiczne); Rodziny Sphenolithidae Deflandre, Braarudosphaeridae Deflandre (kokkolity).
W sumie uczony opisał ponad tysiąc nowych taksonów.