23 1 stycznia 1878 roku Wojnicki został awansowany do stopnia generała dywizji (generał-majora) Od 3 września 1887 Wojnicki był członkiem Komisji Inżynieryjnej Głównego Zarządu Inżynieryjnego; 30 sierpnia 1889 awansowany do stopnia generała-lejtnanta.
W 1900 awansowany został do stopnia generała inżyniera i z powodu stanu zdrowia zwolniony ze służbyСписок генералам по старшинству. Исправлено Составлен по 2 января 1900 года, Санкт-Петербург 1900, c. 187.. Po przejściu na emeryturę mieszkał w Wilnie. Wraz z Janem Trojanem był autorem projektu neoklasycznego budynku Wileńskiego Towarzystwa Przyjaciół NaukMuzeum Sztuki Vytautasa Kasiulisa, Go Vilnius [dostęp 16.08.2023]. W 1914 był członkiem Wileńskiego Oddziału Cesarskiego Rosyjskiego Towarzystwa SadownictwaHenryka.Ilgiewicz, Udział ziemian w wileńskich towarzystwach rolniczych i technicznych na początku XX w, "Studia z Historii Społeczno-Gospodarczej XIX i XX Wieku" nr. 7, 2010, s. 198. Pochowany na Cmentarzu na RossieHenryk Wojnicki, Dziedzictwo za granicą. Baza Poloników [dostęp 16.08.2023].
Prace Henryka Wojnickiego Описание работ по сооружению Константиновской батареи в Кронштадте, Санкт-Петербург 1866 Отопление и вентиляция, курс Технологического ин-та, чит. инж. полк. Войницким 1874-1875 г. - [Санкт-Петербург 1875].