Cheilocystydy liczne, 28–44 × 8–12 µm, o zmiennym kształcie, często wrzecionowato-brzuchate lub z 2–3 igiełkowatymi wypustkami wychodzącymi z wierzchołka, czasami rozwidlone. Nabrzmiałe części cheilocystyd są pokryte krótkimi pręcikowatymi wypukłościami lub brodawkami. Miąższ skrzeli jest winno-brązowy po zabarwieniu jodem. Miąższ kapelusza składa się z bardzo powiększonych komórek, których powierzchnia jest pokryta komórkami o kształcie od maczugowatego do prawie kulistego i wymiarach 25–40 na około 20 µm. Ich ściany są drobno brodawkowate, a wszystkie komórki oprócz brodawkowatych pod działaniem jodu są winno-brązowe. W strzępkach liczne sprzążki. Gatunki podobne Młode okazy grzybówki delikatnej są łatwo rozpoznawalne po kapeluszu pokrytym podobnymi do cukru granulkami i trzonie z nabrzmiałą podstawą przypominającą dysk. Granulki kapelusza stają się mniej wyraźne z wiekiem, ale pozostałości można zwykle znaleźć za pomocą ręcznej soczewki. Do podobnych grzybówek należą grzybówka długoszowa M. alphitophora i grzybówka dyskowata M. stylobates. Grzybówka długoszowa również ma ziarnisty kapelusz, ale podstawa jej trzonu nie jest nabrzmiała ani krążkowata.