Miał dwoje dzieci: syna Wojciecha i córkę Agnieszkę.
Odznaczenia, wyróżnienia i upamiętnienie Ordery i odznaczenia Krzyż Komandorski z Gwiazdą Orderu Odrodzenia Polski – 2010, pośmiertnie Złoty Medal „Za zasługi dla obronności kraju” – 2010 Srebrny Medal „Za zasługi dla obronności kraju” – 2009 Odznaka honorowa „Za Zasługi dla Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej” Krzyż Wielki Orderu Pro Merito Melitensi (Zakon Maltański)
Nagrody i wyróżnienia Tytuły honorowego obywatela Jarosławia, Jasła, gminy Dydnia, gminy Jasło, Brzozowa Honorowy Krzyż Zrzeszenia „Wolność i Niezawisłość” Odznaka honorowa „Zasłużony dla Województwa Podkarpackiego” (pośmiertnie, 2010) Złoty Medal „Za Zasługi dla Pożarnictwa” Odznaka „Przyjaciel Dziecka” Złota Honorowa Odznaka PZM (2002) Złota Odznaka Honorowa Związku Inwalidów Wojennych RP Tytuł „Człowieka Roku 1995 Województwa Krośnieńskiego” przyznany przez tygodnik „Nowe Podkarpacie” Tytuł honorowego prezesa Jasielskiego Klubu Sportowego Czarni 1910 Jasło
Upamiętnienie Imieniem Stanisława Zająca nazwano Park Rekreacji i Edukacji Ekologicznej w Foluszu (2010) oraz Małą Aulę Uniwersytetu Rzeszowskiego (2015).