To wymusiło przykładania większej wagi do spraw wojskowych niż w pozostałych miastach dominium warmińskiegoJan Ptak, Wojskowość średniowiecznej Warmii, Rozprawy i Materiały Ośrodka Badań Naukowych im. Wojciecha Kętrzyńskiego w Olsztynie, nr 172,. Olsztyn 1997, s. 43–44. Chorągiew Braniewa liczyła ok. 200 zbrojnych, z czego ok. połowę stanowili mieszkańcy samego miasta, tj. mieszczanie, posiadacze majątków miejskich i sołtysi wsi miejskich. Natomiast pozostałe 100 osób stanowili żołnierze zaciężni. Chorągiew braniewska znakowała się banderą z dwoma krzyżami, białym i czarnym, co również nawiązywało do symboliki hanzeatyckiej.
Uczestnictwo chorągwi z Braniewa w bitwie pod Grunwaldem zakończyło się jej klęską i rozbiciem – tak jak pozostałych wojsk krzyżackich. Po bitwie trofeami wojennymi było przede wszystkim 51 zdobytych chorągwi krzyżackich. Szczegółowy ich opis wraz z ilustracjami podał Jan Długosz w swoim dziele Banderia Prutenorum, spisanym w XV wieku.