Lifting W 2001 roku Hyundai Atos pierwszej generacji razem z droższym Atosem Prime przeszedł drobną restylizację nadwozia. Samochód otrzymał odświeżone klosze reflektorów i lamp, a także chromowaną poprzeczkę w atrapie chłodnicy i odświeżony wygląd zderzaka. Pojawiły się też zmiany pod kątem wykorzystanych materiałów w kabinie pasażerskiej.
Sprzedaż Hyundai Atos został skonstruowany jako samochód globalny. Trafił on do sprzedaży na rynkach azjatyckich, latynoamerykańskich i na Bliskim Wschodzie, a także w Europie, z czego w Wielkiej Brytanii samochód otrzymał inną ostatnią literę w emblemacie, nosząc nazwę Hyundai Atoz.
Samochód produkowano także w Malezji pod lokalną marką Inokom jako Inokom Atos, a po restylizacji adaptującej pas przedni z globalnego Atosa Prime II zyskując dłuższą nazwę, Inokom Atos Prima.
Silnik L4 1.0l Epsilon
Atos Prime
thumb|left|225px|Hyundai Atos I – tył thumb|left|225px|Hyundai Atos Prime I po liftingu thumb|left|225px|Hyundai Atos Prime I – tył po liftingu thumb|left|225px|indyjski Hyundai Santro
Hyundai Atos Prime I został zaprezentowany po raz pierwszy w 1999 roku.