Nektar nagrał jeszcze album Evolution (2004), zanim Freeman został zastąpiony przez Toma Hughesa. Dembo i Hughes odeszli w sierpniu 2006 roku, powołując się na problemy z komunikacją, pieniędzmi, kwestie osobowości i zaufanie w kwestiach zarządzania. Dembo został na krótko zastąpiony przez powracającego Carmine Rojasa, zanim zespół zdecydował się na skład złożony z Albrightona, Howdena, gitarzysty Steve’a Adamsa, basisty Deshy Dunnahoe i klawiszowca Steve’a Matterna. Jednak ten skład nigdy nie pojawił się na scenie publicznie.
Później w 2006 roku zespół znalazł nowego menedżera w osobie Roya Claya, który zastąpił personel The Eclectic Records, grając w niepełnym wymiarze godzin „Prog fests” na całym świecie i od czasu do czasu pojawiając się w niektórych miejscach New Jersey/Nowy Jork. Clay został zwolniony z obowiązków na początku 2007 roku, po sporze o kwestie finansowe. Zespół złożył oficjalną skargę, która ujawniła kolejne nieuczciwe działania. Clay został ostatecznie skazany za oszustwa finansowe na 2 lata i 11 miesięcy więzienia.