W 1935 roku 5 eskadra okrętów podwodnych średniego zasięgu, w której służyły jednostki typu Pisani, została przeniesiona do La Spezia, wchodząc w skład 1. Flotylli (wł. Gruppo) okrętów podwodnych. W 1936 roku okręty typu Pisani przebazowano na Leros, gdzie utworzyły 2 eskadrę 6. Flotylli okrętów podwodnych. Podczas wojny domowej w Hiszpanii „Giovanni Bausan” wykonał misję specjalną, nie wchodząc w kontakt z wrogiem. W 1938 roku okręty typu Pisani przebazowano do Mesyny, gdzie weszły w skład 31 eskadry 3. Flotylli okrętów podwodnych.
10 czerwca 1940 roku, w momencie ataku Włoch na Francję, okręt nadal znajdował się w składzie 31 eskadry okrętów podwodnych 3. Flotylli w Mesynie (wraz z siostrzanymi „Vettor Pisani”, „Marcantonio Colonna” i „Des Geneys”). Dowództwo jednostki sprawował kmdr ppor. (wł. capitano di corvetta) Francesco Murzi. Od 12 czerwca „Giovanni Bausan” został wysłany na wody Cieśniny Sycylijskiej nieopodal Malty, dołączając do . 13 czerwca 1940 roku, podczas powrotu do Augusty, „Giovanni Bausan” dzięki manewrowi uniknął wystrzelonej przez wrogi okręt podwodny torpedy. Między 20 a 24 czerwca został wysłany z rejonu Dodekanezu w celu sprawdzenia wód wokół Andikitiry, jednak z powodu poważnego uszkodzenia przednich sterów głębokości został zmuszony do przerwania misji i powrotu do bazy.