Węgry i Słowacja (12 września) Pielgrzymka rozpoczęła się w Budapeszcie, gdzie po oficjalnym powitaniu papież udał się do Muzeum Sztuk Pięknych na spotkanie z prezydentem Jánosem Áderem i premierem Viktorem Orbánem. W programie znalazły się również rozmowy z węgierskim episkopatem oraz przedstawicielami Ekumenicznej Rady Kościołów i społeczności żydowskich. Centralnym punktem wizyty na Węgrzech była uroczysta Msza św. Statio Orbis na Placu Bohaterów. Po południu papież odleciał do Bratysławy, gdzie po ceremonii powitania odbyło się spotkanie ekumeniczne oraz prywatna rozmowa z członkami Towarzystwa Jezusowego w Nuncjaturze Apostolskiej.
Słowacja (13–15 września) Drugi dzień wizyty rozpoczął się od oficjalnej ceremonii powitania w Pałacu Prezydenckim przez prezydent Zuzanę Čaputovą, po której nastąpiło spotkanie z władzami, społeczeństwem obywatelskim i korpusem dyplomatycznym. Następnie w katedrze św. Marcina papież rozmawiał z duchowieństwem i katechistami. Po południu Franciszek odwiedził „Centrum Betlejemskie”, spotkał się ze społecznością żydowską na Placu Rybnym oraz przyjął w Nuncjaturze przewodniczącego Rady Narodowej i premiera Eduarda Hegera.