W przypadku awansu, którejś z drużyn nierozstawionej, w II rundzie przejmuje ona współczynnik najwyżej rozstawionego rywala.

Oznaczenia: Drużyny, które awansowały z I rundy eliminacyjnej zachowując swój współczynnik.

Drużyny, które zaczęły rywalizację od II rundy eliminacyjnej.

Drużyny, które awansowały z I rundy eliminacyjnej, przejmując współczynnik rywala.

Grupa 1 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. FCSB21.000 Hapoel Beer Szewa17.500 Apollon Limassol13.500 Worskła Połtawa6.620 FK Čukarički5.350 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. KuPS Kuopio5.000 Arda Kyrdżali4.075 Sumqayıt FK3.375 Szachtior Karaganda3.125 MŠK Žilina2.725 Grupa 2 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. FK Astana22.500 Maccabi Tel Awiw20.500 PFK Soczi7.676 Sivasspor6.020 AEL Limassol5.550 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. Aris FC5.200 Sutjeska Nikšić4.750 Keşlə Baku3.375 Petrocub Hîncești3.000 KF Vllaznia2.750 Grupa 3 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Partizan Belgrad18.000 BATE Borysów17.500 Dundalk F.C.10.500 Milsami Orgiejów6.250 FK RFS5.250 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp. DAC Dunajská Streda5.000 IF Elfsborg4.100 Tallinna FCI Levadia3.750 Puskás Akadémia FC3.100 Dinamo Batumi2.750 Grupa 4 Drużyny rozstawione Drużyna Wsp. Viktoria Pilzno33.500 HNK Rijeka13.500 CSKA Sofia8.000 The New Saints F.C.7.500 NK Domžale5.500 Drużyny nierozstawione Drużyna Wsp.