Znajomość pozwoliła Today'owi na powrót do Afryki w 1907 jako przedstawiciel British Museum, a następnie jeszcze raz, jako pracownik Compagnie du Kasai. W trakcie jednej z wypraw, jesienią 1909, został raniony przez nosorożca.

W trakcie pobytu prowadził badania etnograficzne mieszkańców basenu rzeki Kwilu. Zgromadził kolekcję ponad 3000 przedmiotów (głównie zdjęć i rzeźb), z których ok. 3000 trafiło do British Museum a 391 do Węgierskiego Muzeum Etnograficznego. Jednym z jego osiągnięć było wyznaczenie chronologii władców Kuba (Buszongo) – dzięki wywiadom udało mu się ustalić, że w trakcie panowania 98. z władców miało miejsce zaćmienie Słońca, którego datę określił na 30 marca 1680.

Do Europy wrócił w 1909, aby opublikować wyniki swoich badań. W 1910 otrzymał za nie Cesarski Złoty Medal Nauki i Sztuki. W tym samym roku ożenił się ze Szkotką Gaią Macdonald, a dwa lata później urodziła im się córka.

Wykładał na Węgrzech, w Belgii, Francji. W 1913 wykładał w Filadelfii a następnie rozpoczął praktykę medyczną w Londynie.