W 1937 r. został twórcą pierwszego laboratorium konserwacji krwi, które założył w Cook County Hospital. Pod wpływem sugestii córki Ruth uruchomił je pod nazwą bank krwi. Instytucja zaczęła działać 15 marca 1937 r. Bank krwi Fantusa i jego procedury zostały potem powielone przez wiele innych instytucji, w tym przez amerykańską armię w czasie II wojny światowej. Fantus był także autorem nazwy, która została przyjęta i rozpropagowana na całym świecie.
Po studiach współpracował z University of Illinois College of Medicine and Pharmacy, kierował także jednym z oddziałów w Cook County Hospital. Zaangażowany w pracę naukową, był autorem licznych artykułów i książek, w tym pozycji popularyzatorskich – także dla dzieci. Ponadto był autorem dwóch podręczników Text-book of Prescription-Writing and Pharmacy i Essentials of Prescription-Writing. Członek US Pharmacopoeia and National Formulary, wieloletni redaktor Merck Manual and Yearbook of General Therapeuics. W wykładach dla studentów kładł duży na konieczność uważnego słuchania pacjentów, dokładne diagnozowanie i zapewnianie troskliwej opieki. Ponadto prowadził prywatną praktykę, w której często przyjmował pacjentów nieposiadających odpowiednich środków na opłacenie terapii.