Jednak wskutek rozpoczęcia działań wojennych w czasie II wojny światowej na terenie Włoch mistrzostwa 1943/44 zostały odwołane. W 1944 startował w wojennych rozgrywkach Campionato Venezia Giulia, plasując się na czwartej pozycji.
Po zakończeniu II wojny światowej, klub wznowił działalność w 1945 roku i wkrótce podzielił się na dwa kluby - pierwszy z nazwą AC Monfalconese (ACM) został zakwalifikowany do rozgrywek Serie C, a drugi z nazwą C.R.A. C.R.D.A. rozpoczął rozgrywki w Seconda Divisione. W 1948 po kolejnej reorganizacji systemu lig pierwszy klub (ACM) spadł do Promozione, a rok później drugi klub (CRDA) zdobył awans do Promozione. W 1952 oba kluby (A.C.M. i C.R.A. C.R.D.A.) zjednoczyły się. Połączony klub z nazwą Circolo Ricreativo Aziendale C.R.D.A. startował w IV Serie (D4), która w 1957 zmieniła nazwę na Campionato Interregionale - Prima Categoria. W 1959 klub awansował do Serie C, ale po roku spadł z powrotem do Serie D. W 1962 wrócił do Serie C. W 1968 klub zmienił nazwę na AC Monfalcone. W 1971 został zdegradowany do Serie D, a w 1974 na rok do Promozione Friuli-Venezia Giulia (D5). Przed rozpoczęciem sezonu 1978/79 Serie C została podzielona na dwie dywizje: Serie C1 i Serie C2, wskutek czego Serie D została obniżona do piątego poziomu.