Serie kriżniańska i choczańska zbudowane są głównie z mezozoicznych wapieni i dolomitów.
Płaszczowina fatrzańska reprezentowana jest przez sukcesję Zliechowa (słow. zliechovská jednotka). Płaszczowina hronowska zachowana jest jedynie fragmentarycznie, np. w Tematínie i na zamku Beckov. Obie płaszczowiny składają się z osadów powstałych od triasu do wczesnej kredy, głównie wapieni, margli i dolomitów.
Rzadkie relikty szczególnie wykształconych skał jednostki Belic występują lokalnie w bloku północnym i południowym.
Relikty osadów klastycznych paleogeńskiego basenu wewnątrzkarpackiego znajdują się na zachodnich zboczach gór.
Wody Góry Inowieckie są odwadniane przez liczne drobne potoki spływające do Wagu i Nitry. W północnej części pasma są liczne źródła kwaśnych wód mineralnych i wód termalnych o temperaturze do 65 do 67 °C (w dzielnicy Piešťan Kúpeľný ostrov).
Roślinność Góry Inowieckie są porośnięte lasami liściastymi – dębowymi, w wyższych partiach – dębowo-grabowymi, a w najwyższych – bukowymi.