Po zwycięstwie studentów z Princeton, Libbey sprzedał wszystkie wstążki, a kolory pomarańczowy i czarny zaczęły odtąd być powszechnie używane jako barwy uczelniane (oficjalnie przyjęto je w 1896 roku).
W 1877 roku ukończył studia, zaś w lipcu tego samego roku wyruszył na ekspedycję naukową w zachodnią część kraju, podczas której dokonał pierwszego udokumentowanego wejścia na Mount Princeton. W czasie tej wyprawy wszedł łącznie na 40 różnych szczytów (m.in. na Grays Peak i Mount Lincoln). Po tym wyczynie podjął studia w Berlinie i Paryżu, po czym powrócił na swoją macierzystą uczelnię, na której w 1879 roku uzyskał doktorat z geologii. Był uczestnikiem wielu innych wypraw i ekspedycji, np. w 1888 roku na Alaskę, co upamiętniono w nazwie jednego z lodowców u podnóża Góry Świętego Eliasza, który został nazwany na jego cześć (Libbey Deep). Nazwa lodowca była także nadana jako hołd za wkład Libbeya w opisanie Golfsztromu. Odwiedził także m.in. Rosję, Hawaje, Grenlandię i Liban. W 1902 roku przejechał prawie 1000 km konno przez Palestynę, eksplorując dolinę Jordanu i Petrę. Uczestniczył ponadto w dwóch ekspedycjach Roberta Peary’ego. Pełnił wysokie funkcje w lokalnych instytucjach finansowych (m.in. w Princeton Savings Bank i First National Bank).