Migracje te ostatecznie zakończyły się na przełomie wieków XVI i XVII nadając ostateczny kształt narodowościowy tym terenom do roku 1772 – obszar ten aż do 1947 roku zamieszkiwała ludność polska, jak i łemkowska (rusińska), kiedy to ludność łemkowska została wysiedlona.
W 1657 przez Beskid Niski przeszły wojska Rakoczego. W latach 1768–1772 Beskid Niski stanowił ważny obszar w czasie konfederacji barskiej – szczególnie w jej późniejszym okresie, po upadku Krakowa. Od kwietnia 1769 do sierpnia 1770 walczył na tych terenach, dowodząc oddziałami konfederatów, Kazimierz Pułaski. Nieliczne już ślady okopów konfederackich można spotkać po dziś dzień, np. w rezerwacie „Okopy Konfederackie” nad Muszynką na obrzeżu Beskidu Niskiego. mały|Strój łemkowski Pasterze wołoscy mieszając się na przestrzeni wieków z ludami ruskimi oraz ulegając wpływom polskim i węgierskim utworzyli nową grupę etniczną zwaną od II poł. XIX wieku Łemkami.
W 1915 na tych terenach rozegrała się bitwa pod Gorlicami określana małym Verdun.
Działania I wojny światowej na terenie Beskidu Niskiego, gdzie przechodził front wojenny, dokonały dużych spustoszeń i pochłonęły tysiące ofiar. Szczególną pamiątką po tych wydarzeniach są liczne austriackie cmentarze wojenne z tego okresuhttps://podkarpackie.travel/top-beskidu-niskiego/slady-wielkich-wojen.