Waldemar Jakub Halota (ur. 19 września 1947 w Szczecinie) – polski lekarz, profesor nauk medycznych, kierownik Katedry i Kliniki Chorób Zakaźnych i Hepatologii, profesor zwyczajny Collegium Medicum im. Ludwika Rydygiera w Bydgoszczy Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu. Specjalista chorób wewnętrznych i zakaźnych, doktor honoris causa Tarnopolskiego Uniwersytetu Medycznego.
Autor dwóch podręczników, kilku monografii, licznych rozdziałów w podręcznikach oraz kilkuset artykułów naukowych. Zainteresowania naukowe są zdominowane problemami chorób zakaźnych i hepatologii.
Życiorys Urodzony w 1947 syn Henryka i Gertrudy Halota, z domu Maślińska.
Po ukończeniu I Liceum Ogólnokształcącego im. Mikołaja Kopernika w Toruniu, studiował na Wydziale Lekarskim Akademii Medycznej w Gdańsku. W 1972 po otrzymaniu dyplomu lekarza medycyny został asystentem w Klinice Chorób Zakaźnych Instytutu Chorób Wewnętrznych tej Uczelni.
W latach na przełomie 1977 i 1978 odbył sześciomiesięczny staż naukowy na Kubie z zakresu chorób tropikalnych.