Dzieła Dziełem życia Glogera była Encyklopedia staropolska ilustrowana (1900–1903), która nadal jest cennym przewodnikiem po kulturze staropolskiej. Inne ważniejsze prace: Obchody weselne (1869), Pieśni ludu (1892), Księga rzeczy polskich(1896), Rok polski w życiu, tradycji i pieśni (1900). Dwie publikacje – Pieśni ludu oraz Encyklopedia staropolska ilustrowana ukazały się dzięki sfinansowaniu edycji przez Witolda Zglenickiego uzyskanych za pośrednictwem Kasy Mianowskiego. Śmierć autora przerwała w połowie drugiego tomu encyklopedyczne wydawnictwo Budownictwo drzewne i wyroby z drzewa w dawnej Polsce (1907–1909, litery A–L). Napisał około 800 prac i artykułów.
Dzieła Zygmunta Glogera dostępne online
Obrzęd weselny polski z pieśniami i przemowami, Warszawa 1901 Budownictwo drzewne i wyroby z drzewa w dawnej Polsce, T. 1 i 2, Warszawa 1907-1909 Dolinami rzek. Opisy podróży wzdłuż Niemna, Wisły, Bugu i Biebrzy, Warszawa 1903 Geografia historyczna ziem dawnej Polski, Kraków 1903 Encyklopedia staropolska, T. 1–4, Warszawa 1900–1903 Księga rzeczy polskich, Lwów 1896 Słownik rzeczy starożytnych, Kraków 1896 Sen Ziemianina, Łomża 1910