W 2. rundzie uczestniczyły drużyny, które awansowały z poszczególnych grup, oraz sześć drużyn z UNIQA extraligi. Półfinaliści Pucharu Czech 2018/2019 rozpoczynali rozgrywki od ćwierćfinałów, natomiast dwie drużyny z extraligi w drodze losowania uzyskały wolny los do 1/8 finału. W drodze losowania utworzone zostały pary meczowe. Drużyny w ramach par rozgrywały jedno spotkanie.
W 1/8 finału oraz w ćwierćfinałach rywalizacja toczyła się w parach zgodnie z drabinką turniejową. Drużyny w poszczególnych parach rozgrywały dwumecz. O awansie decydowała większa liczba zdobytych punktów. Za zwycięstwo 3:0 lub 3:1 drużyna otrzymywała 3 punkty, za zwycięstwo 3:2 - 2 punkty, za porażkę 2:3 - 1 punkt, natomiast za porażkę 1:3 lub 0:3 - 0 punktów. Jeżeli po rozegraniu dwumeczu obie drużyny zdobyły taką samą liczbę punktów, o awansie decydował tzw. złoty set grany do 15 punktów z dwoma punktami przewagi jednej z drużyn. Zwycięzcy w poszczególnych parach ćwierćfinałowych uzyskali awans do turnieju finałowego.
W ramach turnieju finałowego rozegrano półfinały oraz finał.