1 października 1941 pułk został zreorganizowany, utworzone zostały 3 i 65 bojowe bataliony inżynieryjne. W tym samym okresie utworzono 24 i 25 Dywizję Piechoty, a 3 batalion został jednym z elementów 24 Dywizji Piechoty. 7 grudnia 1941 batalion po raz pierwszy zasmakował walki podczas japońskiego bombardowania Schofield Barracks na Hawajach w czasie ataku na Pearl Harbor. W lipcu 1943 batalion wyjechał do Australii, gdzie wraz z innymi jednostkami dywizji odbył intensywne szkolenie. W 1944 batalion opuścił Australię, wziął udział w operacjach w zatoce i w bitwie o Jayapura na Nowej Gwinei, a następnie w bitwie o Luzon, walkach o Leyte i Mindanao na Filipinach, wykonując wiele trudnych zadań inżynieryjnych.
Po ustaniu działań wojennych w 1945 roku, batalion wraz z 24 Dywizją Piechoty wziął udział w okupacji Japonii. Stacjonował tam aż do lipca 1950, kiedy przeniesiony został do Korei wraz z resztą 24 Dywizji w celu powstrzymania napływu sił komunistycznych do Korei Południowej. Batalion w latach 1953-1957 przemiennie przebywał w Korei i Japonii.