W 1805 roku w wyniku pokoju w Preszburgu Ferdynand otrzymał Wielkie Księstwo Würzburga, na które przeszły uprawnienia elektorskie, a Księstwo Salzburga zostało włączone do Austrii. Kongres wiedeński ostatecznie potwierdził przynależność Księstwa Salzburga do Cesarstwa Austriackiego. Początkowo włączone było w administrację Arcyksięstwo Austrii za Anizą. Dwudzielny herb dawnego arcybiskupstwa Salzburga został włączony do herbu cesarskiego. Dopiero w 1849 roku Księstwo Salzburga wydzielono jako oddzielny kraj koronny. Oficjalnie herb księstwa został potwierdzony Konstytucją Krajową dla Księstwa Salzburga nadanej Cesarskim Patentem z dnia 30 grudnia 1849 roku.
Kraj związkowy Salzburg W wyniku zniesienia monarchii austro-węgierskiej dotychczasowy kraj koronny Salzburg stał się krajem związkowym nowo powstałej Republiki Austriackiej. Oficjalnie herb kraju związkowego Salzburg został wprowadzony na mocy Konstytucji Krajowej z 16 lutego 1921 roku. Po inkorporacji Austrii przez III Rzeszę herb był nadal używany, pozbawiony został korony i zmieniono rysy lwa.