Charakterystyka Pokémony są stworzeniami o różnych kształtach i rozmiarach, żyjącymi w dziczy albo pośród ludzi. Istnieje ponad tysiąc ich gatunków klasyfikowanych według typów, np. ogniste, psychiczne czy smocze. Każdy typ ma naturalną przewagę nad innym, np. pokémon ognisty jest z natury bardziej podatny na ataki pokémona wodnego, ale silniejszy od trawiastego. Większość pokémonów wykluwa się z jaj. W grach komputerowych Pokémon Gold i Silver po raz pierwszy pojawiły się tzw. lśniące pokémony, różniące się od innych unikatowymi kolorami. Wiele gatunków pokémonów było inspirowanych prawdziwymi zwierzętami i roślinami, takimi jak kijanka szklanej żabki (), drakonowate (), gąsienica (), gurami całujący (), ambystoma meksykańska (), karmazyn żółtooki (), bukietnica Arnolda (), dzbanecznik (), łuskowiec () czy tapir czaprakowy ().