Kolejna modyfikacja bazyliki miała miejsce w latach 1852-1860.
Architektura i sztuka Fasada bazyliki nawiązuje do sanktuarium św. Hieronima w Somasca. Pięcioarkadowy barokowy portal prowadzi do narteksu, w którym po prawej stronie znajduje się statua Benedykta XIII z 1750 roku. Portal główny zdobiony jest cosmatesca.
Świątynia jest trójnawową bazyliką w kształcie litery T, nakrytą sklepieniem kolebkowym. Nawa ma po pięć kolumn arkadowych po obu stronach.
Autorem cyborium był Tommaso de Marchis, składa się ono z czterech kolumn podtrzymujących kopulasty baldachim. W ołtarzu znajdują się relikwie patronów świątyni. W apsydzie znajdują się dwie kolumny z czasów Honoriusza III.
Pod ołtarzem zlokalizowana jest romańska krypta z X wieku, w ołtarzu której przechowywane są relikwie św. Tomasza z Canterbury. Ściany zdobią freski z XII-XIII wieku przedstawiające Baranka Bożego oraz symbole Ewangelistów.
W prawej części transeptu znajduje się kaplica z XIII-wieczną łaskami słynącą ikoną Madonny św. Aleksego.