Słownik etymologiczny nazw geograficznych Śląska i Słownik nazw miejscowości diecezji opolskiej w XX i XXI wieku, utożsamiają nazwę Skrobacz wyłącznie z częścią wsi Trzebina.
Geografia mały|lewo|Panorama Gór Opawskich w pobliżu Młyna Czyżyka (2020) Część miasta obejmuje obszar wokół zabytkowego młyna wodnego zwanego Młynem Czyżyka (ul. Sienkiewicza 5). Młyn Czyżyka położony jest na południe od centrum Prudnika, nad rzeką Prudnik, u podnóża wzniesienia zwanego Czyżykową Górą (263 m n.p.m.). Znajduje się na wschód od Lip i na północ od klasztoru franciszkanów w Prudniku-Lesie, przy drodze prowadzącej do Trzebiny.
Część miasta leży na Nizinie Śląskiej, w pobliżu Gór Opawskich. Według podziału fizycznogeograficznego z 2017 dr. Krzysztofa Badory, Młyn Czyżyka znajduje się na pograniczu mikroregionów Obniżenie Prudnickie (318.58.5), Przedgórze Głuchołasko-Prudnickie (332.17.3) i Dolina Prudnika (318.58.4).