Sytuacja uległa zasadniczej zmianie na skutek antybrytyjskiego powstania Hiszpanów i Kreolów, kierowanego przez gen. Santiago Liniersa. Zgromadzone przez kolonistów przeważające siły wkroczyły do Buenos Aires 10 sierpnia 1806 r., łamiąc opór Brytyjczyków, dowodzonych przez Beresforda. Niekorzystne warunki meteorologiczne uniemożliwiły dowodzonej przez Pophama flocie zarówno pomoc garnizonowi, jak i ewakuację sił inwazyjnych, przez co oddziały lądowe znalazły się w hiszpańskiej niewoli.
Przybycie w rejon La Platy brytyjskich posiłków Hiszpanie uznali za złamanie zasad honorowej kapitulacji podpisanej 12 sierpnia 1806 r. i odmówili zwolnienia brytyjskich żołnierzy. Niepowodzenie to kosztowało Home Riggsa Pophama utratę dowodzenia: 3 grudnia tego samego roku został zastąpiony przez kontradmirała Charlesa Stirlinga i otrzymał rozkaz powrotu do Anglii. 20 lutego 1807 r. oskarżono go o wycofanie sił morskich z Kraju Przylądkowego bez rozkazu oraz o nieautoryzowany atak na hiszpańskie kolonie w Ameryce Południowej.