Hawaiian Sugar Planters’ Association prowadziło swoje badania w latach 1919–1945 pod kierownictwem dr Harolda Lyona. Po zakończeniu prac badawczych stowarzyszenie nie potrzebowało już arboretum dla swoich celów. Dr Lyon zabiegał o pozostawienie ośrodka badań. W 1953 roku teren arboretum został odkupiony od Hawaiian Sugar Planters’ Association przez Uniwersytet Hawajski za 1000 dolarów amerykańskich. Dr Lyon częściowo finansował działalność arboretum ze swoich własnych środków. Po jego śmierci w 1957 roku Uniwersytet Hawajski zmienił oficjalną nazwę obiektu na Arboretum im. Harolda L. Lyona.
Do 1972 roku arboretum pełniło funkcję stacji badawczej i było zamknięte dla publiczności. W 1972 roku stowarzyszenie Lyon Arboretum Association rozpoczęło program informacyjny i edukacyjny dla społeczności, który przyczynił się do otwarcia arboretum dla zwiedzających.
Kolekcja
Kolekcja arboretum i ogrodu botanicznego składa się z ponad 5000 gatunków roślin tropikalnych;