W 2001 został aresztowany przez Palestyńskie Siły Prewencyjne, po tym jak oskarżono go o zaplanowanie samobójczego ataku w kawiarni Wall Street na przedmieściach Haify. W wyniku tego ataku rannych zostało 15 ludzi. Rozkaz aresztowania został wydany przez Yasira ArafataPhilps, Alan. Suicide bomber blows up cafe. The Daily Telegraph. 13 sierpnia 2001. (ang.) [Data dostępu:2018-08-26].. Został jednak wkrótce zwolniony.
W marcu 2003 aresztowano go ponownie. Został oskarżony łącznie o śmierć 66 ludzi. Ostatecznie w 2004 sąd skazał go na karę 67 konsekutywnych dożywotnich wyroków pozbawienia wolności. Był to najwyższy wyrok pozbawienia wolności w historii Izraela.
W 2011 wystąpił o umożliwienie mu spotkania się z rodzinąLevinson, Chaim. Gilad Shalit swap deal / The Hamas wish list of prisoners. Ha-Arec. 11 października 2011. (ang.) [Data dostępu:2018-08-26].. W 2015 roku został przeniesiony do celi izolacyjnej, jako kara za nielegalne (przemycony telefon komórkowy) udzielenie wywiadu dla radio, prowadzonego przez Hamas.