17 września 2018, po porażce 3:5 z Hutnikiem Kraków, Mariusz Sawa został odsunięty od prowadzenia pierwszego zespołu Motoru. Zastąpił go dotychczasowy drugi trener – Robert Chmura. Kontrakt Sawy z klubem został rozwiązany 28 września 2018. 8 października 2018 pierwszym trenerem zespołu został Robert Góralczyk. Rundę jesienną Motor zakończył na 5. miejscu, ze stratą pięciu punktów do lidera Hutnika Kraków. W przerwie zimowej z klubu odeszli Patryk Słotwiński i Irakli Meschija, a Piotr Darmochwał został wypożyczony do końca sezonu do Avii Świdnik.
Piłkarze Motoru do treningów powrócili 7 stycznia 2019. W przerwie zimowej do drużyny dołączyli: Mateusz Majewski (poprz. Ruch Chorzów), Kamil Poźniak (poprz. Puszcza Niepołomice) i Bartosz Waleńcik (poprz. Górnik Łęczna). Do końca sezonu wypożyczono z Górnika Łęczna Kamila Pajnowskiego. Ze względu na mające się odbyć na przełomie maja i czerwca 2019 piłkarskie mistrzostwa świata do lat 20, w ramach których na Arenie Lublin zostanie rozegranych dziewięć meczów, dwa ostatnie spotkania ligowe, z Wiślanami Jaśkowice i Podhalem Nowy Targ Motor rozegra na stadionie Hetmana w Zamościu. Na tydzień przed rozpoczęciem rundy wiosennej Motor pokonał w finale Pucharu Polski na szczeblu Lubelskiego Związku Piłki Nożnej Wisłę Puławy po rzutach karnych 3:1;